Los colores de un mapa pueden ser de gran utilidad si se escoge las combinaciones adecuadas según la información que se desea simbolizar o representar, pero también pueden ser perjudiciales ya que pueden saturar o resaltar una información que no realmente importante en e mapa  hacer compleja la interpretación de la información a representar, por lo que el uso de paletas de colores en las organizaciones de entra puede ser complejo al definir qué color representa qué, pero a largo plazo o en proyectos de gran envergadura la paleta de colores puede facilitar y agilizar el proceso de generar cartografía temática, actualmente existen gran variedad de herramientas que permiten definir una combinación o paletas de colores, que permite dar el mismo grado de importancia a la información a representar sin saturar u ocultar información, a continuación se listaran algunas de  herramientas que permiten seleccionar una buena palea de colores en mapas:

• Color Brewer 2 es una herramienta en linea ya tiene algunos años funcionando pero es una aplicación que tiene vigencia y está directamente relacionada con la selección de colores para cartografía.

http://colorbrewer2.org

En caso que desee importar la paleta a ArcGIS(versiones 9.X)  lee este pdf http://www.extension.iastate.edu/communities/sites/www.extension.iastate.edu/files/communities/PM2082-14e.pdf

• Color Oracle es una herramienta de escritorio con base Java que permite generar paletas colores según se desee tiene buna documentación y el portal de esta aplicación tiene un sección de consejos de diseño muy útiles.

http://colororacle.org

• Adobe Color CC es una herramienta en línea muy eficiente para generar paletas de colores en general.

https://color.adobe.com/es/create/color-wheel/

Estos son algunos de los programas más usados para el diseño  y escogencia de colores para una mapa, espero se ha de utilidad.